Проблему лояльности столь нереволюционного командного состава Троцкий решил по примеру Великой французской революции, назначавшей в действующую армию облеченных особыми полномочиями «комиссаров Конвента» для присмотра за генералами-аристократами. В Красной Армии тоже появился институт комиссаров — параллельной военной власти. Вместо традиционного единоначалия вводилось двуначалие. Комиссар должен был не только приглядывать за командиром-военспецом, но и идейно направлять массы мобилизованных солдат, большинство которых не имели никаких политических взглядов. (В ходе войны белые, постоянно нуждавшиеся в пополнениях, захватив пленных, обычно расстреливали только партийных, а остальных красноармейцев просто ставили в строй, и те послушно воевали с большевиками). На низовом уровне невысокую идейность принудительной армии укрепляли мобилизованные коммунисты, которых в массовом порядке посылали на фронт. Половина всех членов партии была направлена в воинские части.
Третью задачу, восстановления дисциплины, Троцкий решал намного жестче, чем годом ранее главковерх Корнилов. Тот всего лишь ввел на фронте смертную казнь, которая на практике применялась очень редко. В Красной Армии это была обычная, причем внесудебная кара за всякое мало-мальски серьезное нарушение. В самый отчаянный для советской власти момент — когда летом 1918 года красные полки пятились и разбегались под напором белочехов и «Народной армии» Комуча — Троцкий приказал казнить на месте командиров и комиссаров деморализованных частей, а рядовых красноармейцев подвергал децимации, то есть расстреливал каждого десятого.
«Бронепоезд Председателя Революционного Военного Совета Республики»
И все же наскоро созданная Красная Армия была еще очень слаба. Невзирая на огромное численное превосходство, контрнаступление, предпринятое ею в августе, завершилось неудачей. Новое наступление, осеннее, позволило оттеснить войска Комуча за Волгу, но дальше сложилась патовая ситуация.
Однако в ноябре 1918 года положение кардинально изменилось. Влияние «германского фактора» на внутрироссийскую ситуацию закончилось, потому что сначала в Австро-Венгрии, а затем в Германии и Турции произошла революция. Все три империи рухнули.
Непосредственным следствием этого события стал кризис «южной Вандеи» атамана Краснова, который без поддержки немцев не мог противостоять красным отрядам. На Дону установилась советская власть.
Вскоре ослабело и белое сопротивление на востоке. Значительная часть чехословаков поспешила вернуться домой — чтобы участвовать в создании новой страны, Чехословакии. В одиночку «Народная армия» Комуча, наполовину состоявшая из ополчения, которое мало чем отличалось от красноармейских формирований, стала отступать в сторону Урала.
В конце 1918 года казалось, что Советская республика уже одержала победу в Гражданской войне.
На самом деле война только теперь начнет разворачиваться во всю силу.
Причин было две — внешняя и внутренняя.
Первая состояла в том, что у стран Антанты после поражения Германии освободились руки (а также гигантские запасы оружия и снаряжения). Теперь бывшие союзники царской России могли принять более активное участие в борьбе за будущее этой важной страны.
Во-вторых, «германский фактор» в значительной степени сдерживал обе стороны — и белую, и красную — от эскалации. Теперь стихия взаимной ненависти вышла из-под контроля.
Не в последнюю очередь обострению гражданской войны способствовала политика, которую проводила советская власть.