В 1979 году при поддержке главы Учебного комитета при Священном Синоде митрополита Таллинского и Эстонского Алексия (будущего Патриарха Московского и всея Руси) в Ленинградской духовной семинарии и академии было открыто регентское отделение, на котором обучались девушки. Чтобы преодолеть сопротивление властей этой инициативе ректора, было организовано прошение православных женщин из Финляндии, выразивших желание обучаться церковному пению при академии.[117]
Открытие регентского отделения стало важным событием в жизни Ленинградских духовных школ. Архиепископ Кирилл писал в те годы:
Ректор вспоминал слова Патриарха Алексия I, сказанные в 1948 году:
Архиепископ Выборгский Кирилл с выпускницами регентского отделения. Ленинград, 1970-е гг.
К концу 70-х годов XX века положение оставалось не многим лучше, в основном вследствие отсутствия профессиональных регентов и учебных заведений для их подготовки. Создавая регентское отделение в Ленинградской духовной семинарии и академии, ректор так сформулировал свою задачу — учреждение
Вспоминает регент Воскресенского собора в Нарве Л. Ворожейкина-Харитонова, в 1979 году вошедшая в число первых студентов регентского класса при Ленинградской духовной академии:
Особой заботой ректора было преподавание древних и новых языков: были разработаны новые курсы церковно-славянского языка, оборудован лингафонный кабинет, в академии в рамках преподавания греческого языка был введен курс по текстологии Нового Завета с самостоятельными работами студентов. В годы ректорства будущего Патриарха Ленинградские духовные школы фактически стали одним из образовательных центров мирового Православия: число студентов из братских Православных Церквей все время возрастало, в результате в 1981/82 учебном году был образован факультет иностранных студентов с программами преподавания русского языка.
Архиепископ Выборгский Кирилл с учащимися регентского отделения Ленинградской духовной семинарии
Ректору удалось организовать новые научные кафедры (кафедру литургики в 1981/82 учебном году, а также кафедры общецерковной истории и истории Русской Церкви и славянских Церквей в 1982/83 учебном году). Новые учебные курсы настоятельно требовали и других учебников. Были созданы новые или серьезно переработаны прежние пособия по изучению Священного Писания, по основному богословию, византологии, церковной археологии, новейшей истории, истории унии (что было очень важно в связи с большим числом учащихся из западных областей Украины, где исторически позиции унии были сильны). Ректор принимал непосредственное участие в рецензировании и научном редактировании новых учебников и пособий.
Важнейшей задачей духовной школы архиепископ Кирилл считал преодоление разрыва между русской богословской наукой, находившейся в вынужденной изоляции, и достижениями западной богословской мысли. Он поставил на систематическую основу перевод сочинений западных авторов на русский язык:
Помимо административной работы ректор вел преподавательскую деятельность. Начиная с 1975/76 учебного года он читал на первом курсе академии лекции по патрологии, в начале 80-х годов также читал лекции по истории экуменизма в аспирантуре при Московской духовной академии. Архиепископ Кирилл выступал с лекциями в богословских центрах Финляндии: в университете Хельсинки, на пастырском семинаре в Куопио, в Турку, в отечественных академических институтах, например в Институте востоковедения Академии наук СССР в Ленинграде, издавал свои научные статьи и исследования. После публичной лекции «Особенности раннехристианского церковного устройства в свете решения вопроса о времени и месте происхождения Дидахи» архиепископу Кириллу было присвоено звание доцента (28 марта 1978).
Одну из главных своих задач как организатора церковной науки и образования Владыка Кирилл видел в соединении церковного знания с нуждами современной церковной и общественной жизни: открытые и сформулированные отцами и учи́телями Церкви знания о Боге, Церкви, человеке необходимо вписывать в конкретный историко-культурный контекст. В отзыве на новый учебник по истории Русской Церкви ректор писал:
Встреча иностранной делегации в Ленинградской духовной академии. 1970-е гг.
Ректор активно вовлекал преподавателей и студентов Ленинградских духовных школ в международную деятельность. Представители Ленинградской духовной академии участвовали в богословских диалогах, в ассамблеях Синдесмоса, заседаниях Центрального комитета и различных рабочих групп ВСЦ. В Ленинградских духовных школах проводились международные семинары и конференции, на которые приглашались видные богословы из-за рубежа; студенты и преподаватели Ленинградской духовной академии смогли в декабре 1980 года посетить Святую Землю. Активная международная научная деятельность Ленинградских духовных школ не только расширяла богословский кругозор преподавателей и студентов, но и способствовала укреплению авторитета и позиции Ленинградской духовной академии в ее противостоянии богоборческой власти.
Академическую деятельность архиепископ Кирилл совмещал с работой на церковно-дипломатическом поприще.
Спустя полгода после хиротонии он был назначен заместителем Патриаршего экзарха Западной Европы, помогая в этом служении митрополиту Никодиму. После назначения экзархом митрополита Филарета (Вахромеева) архиепископу Кириллу было поручено окормление патриарших приходов в Финляндии. В 1976 году Владыка Кирилл вошел в Комиссию Священного Синода по вопросам христианского единства и межцерковных сношений (с 1979 года — Комиссия по вопросам христианского единства) и стал принимать самое активное участие в работе этого органа, в котором под председательством митрополита Никодима разрабатывалась стратегия дипломатической деятельности Русской Церкви в международной обстановке «холодной войны».
Архиепископ Кирилл сразу стал одним из ведущих дипломатов Русской Церкви. В наиболее драматичный период международного противостояния эта ответственность только возрастала — и в связи с преждевременной кончиной митрополита Никодима 5 сентября 1978 года, и в результате смены руководства ОВЦС в 1981 году (35-летний архиепископ Кирилл был одним из четырех кандидатов, предложенных митрополитом Ювеналием (Поярковым) на должность председателя ОВЦС в 1981 году).
В 1976 году Константинопольский Патриархат попытался провести Первое Всеправославное предсоборное совещание, повестку дня которого и процедуру принятия решений определил самостоятельно. При этом были фактически проигнорированы рекомендации предшествующих подготовительных совещаний, последнее из которых (четвертое) состоялось в 1968 году в Шамбези.
Несогласие со стороны Русской Православной Церкви с такой позицией Константинопольский Патриархат сразу же стал трактовать как отказ Русской Церкви от участия во Всеправославном совещании (возможно, это и было главной целью такого демарша), что могло привести к расколу в православном мире. В этих условиях от небольшой (в составе трех человек) делегации Русской Православной Церкви требовались не только дипломатический опыт, но и твердость в отстаивании своей позиции и огромная выдержка. В делегацию на совещание в Шамбези в ноябре 1976 года был включен и архиепископ Кирилл.