Когда греко-католики начали громить православные епархии на Западной Украине, была создана по инициативе митрополита Кирилла четырехсторонняя комиссия, в которую вошли представители Украинской Православной Церкви, Греко-Католической Церкви, Русской Православной Церкви и Ватикана. Задачей комиссии было рассмотрение спорных случаев, когда на один и тот же храм претендовали и православные, и греко-католики. Работа комиссии начиналась успешно, в семи случаях удалось разрешить споры миром.
Встреча между представителями Римско-Католической и Русской Православной Церквей. 12–17 января 1990 г.
Ватикан официально признавал, что
Католический прозелитизм был направлен на обращение в католичество тех людей, которые по своим духовным корням принадлежали к Православной Церкви. Поскольку II Ватиканский Собор назвал Католическую и Православную Церкви «Церквами-Сестрами», митрополит Кирилл неоднократно заявлял: если католики верны этому принципу, они должны относиться к Православной Церкви как к сестре, а не пытаться оторвать от нее верующих.
Богословскому осмыслению унии были посвящены заседания Смешанной комиссии по православно-католическому диалогу. Русской Православной Церкви и представлявшему ее интересы митрополиту Кириллу удалось сплотить все Православные Поместные Церкви и выработать единую позицию по отношению к униатской агрессии. По докладу митрополита Кирилла в декабре 1990 года в Стамбуле Межправославная комиссия по богословскому диалогу между Православной и Римско-Католической Церквами приняла заявление, что
Эта тема стала главной и в переговорах митрополита Кирилла с папой Иоанном Павлом II в марте 1991 года. Позиция Католической Церкви, изложенная на встрече в Женеве в марте 1992 года, состояла в полном оправдании прозелитических действий своих епархий и орденов
От ОВЦС потребовались напряженные усилия для доказательства правоты позиции Русской Православной Церкви. 23 июня 1993 года на заседании в Баламанде (Ливан) было подписано соглашение, в котором католическая сторона признала ошибочность унии как метода достижения церковного единства:
Фактическое осуждение унии, состоявшееся в Баламанде, было позитивно воспринято Поместными Православными Церквами. В то же время в некоторых Церквах, в частности в Московском Патриархате, вызвали критику те утверждения Баламандского соглашения, в которых о Православной и Католической Церквах говорилось как о Церквах-сестрах, имеющих общую миссию:
Тема унии обсуждалась 12–13 января 1996 года на встрече митрополита Кирилла в Риме с председателем Папского совета по содействию христианскому единству кардиналом Эдвардом Кассиди. В совместном заявлении было подтверждено, что в документах и заявлениях Римско-Католической Церкви, а также в документах, принятых обеими Церквами,
Движение к нормализации отношений было трудным: в 1997 году на заседании в Константинопольском Патриархате представители всех Православных Церквей постановили продлить мораторий на темы для обсуждения с Римско-Католической Церковью, ограничив консультации вопросами преодоления унии и прозелитизма. Эти же проблемы были названы Священным Синодом Русской Православной Церкви главными препятствиями для возможной встречи Папы Римского и Патриарха Московского и всея Руси.
Обсуждение продолжилось в 1998–1999 годах. Надежды на разрешение этих вопросов на Восьмой пленарной сессии Смешанной международной комиссии по богословскому диалогу между Православной и Римско-Католической Церквами (2000 год, Балтимор, США) также не оправдались: римо-католики не только не были готовы продолжать диалог, но фактически отказались даже от достигнутых договоренностей (в частности, было заявлено, что католическая сторона считает униатство нормальным явлением, поскольку униаты находятся в общении с Римом). После недели безрезультатных прений диалог был остановлен без планов его продолжения в будущем.
В начале 2000-х годов напряжение в отношениях Русской Православной Церкви с Ватиканом усилилось в связи с несогласованным с Украинской Православной Церковью визитом Папы Иоанна Павла II на Украину в 2001 году и созданием в 2002 году на канонической территории Русской Церкви новых католических епархий и структур. 11 февраля 2002 года было объявлено о решении Папы Римского «повысить статус административных структур» Римско-Католической Церкви на территории России до уровня епархий, а территорию России трактовать как «церковную провинцию» во главе с митрополитом. Летом этого же года епархии Римско-Католической Церкви были созданы на юге и востоке Украины.
В заявлении Патриарха Алексия II и Священного Синода были названы причины такого решения Ватикана: действия Римско-Католической Церкви,
Позиция Русской Православной Церкви была поддержана многими Поместными Православными Церквами. Митрополит Кирилл направил жесткое послание архиепископу Тадеушу Кондрусевичу, возглавлявшему епархию Римско-Католической Церкви в Москве, в котором говорилось:
Относительная стабилизация православно-католических отношений началась через два года, во время визита в Москву делегации Папского совета по содействию христианскому единству во главе с его председателем кардиналом Вальтером Каспером. На переговорах с ним Русская Православная Церковь твердо заявила, что дальнейший диалог возможен только при условии отказа от прозелитизма: нужен
Встреча митрополита Кирилла с Папой Бенедиктом XVI
Ситуация стала улучшаться после избрания главой Римско-Католической Церкви Папы Бенедикта XVI, с которым митрополит Кирилл провел встречу в первые же дни нового понтификата. По словам Владыки,
В условиях кризиса в диалоге с Римско-Католической Церковью митрополит Кирилл сосредоточил усилия на совместных действиях в области защиты и укрепления общехристианских ценностей[319], что сохранило возможность возобновления диалога. Сотрудничество в консолидации позиции двух Церквей перед лицом наиболее важных проблем, волнующих человечество, высоко оценили и Папа Бенедикт XVI, и Архиерейский Собор Русской Православной Церкви 2008 года, констатировавший
Заседание Архиерейского Собора Русской Православной Церкви. 2008 г.
Среди проблем, существующих в отношениях с католиками, Собор назвал ущемление прав верующих Православной Церкви на западе Украины, многочисленные попытки искусственного расширения униатского присутствия во многих регионах, необоснованную претензию Украинской Греко-Католической Церкви на общенациональный статус на Украине, прозелитическую активность отдельных католических клириков среди лиц, принадлежащих к Православию по крещению, национальной и семейной традиции.